斐伊川は、その源を島根県仁多郡奥出雲町の船通山（標高1,143m）に発し、起伏が穏やかな中国山地を下り、横田盆地をゆるやかに流れた後、山間峡谷部を急流になって下り、下流に広がる出雲平野を東に貫流し、宍道湖、大橋川、中海、境水道を経て日本海に注ぐ一級河川です。

中流部には、メダケ、ヤナギ類、水際にはツルヨシ等が生育し、砂地を好むスナヤツメやカワムツ、オイカワ等が生息・繁殖しています。